Émilie Bauduin est candidate en cotutelle au doctorat en études littéraires à l’Université du Québec à Montréal, sous la direction de Véronique Cnockaert, et au doctorat en Littérature et civilisation françaises à l'Université Paris III-Sorbonne Nouvelle, sous la direction d'Éléonore Reverzy.

Ses recherches, financées par le Conseil de recherche en sciences humaines (CRSH), visent à interroger les rapports dialectiques entre le propre et le sale, le pur et l’impur, le souillé et le lessivé qui animent l’imaginaire hygiénique dans l’œuvre romanesque d’Émile Zola.